Die Werftdivisionen waren die Personalstammeinheiten für das technische und Verwaltungspersonal.
Hier wurden Matrosen im Boots-, Artillerie- und Infanteriedienst ausgebildet.
Allerhöchste Cabinets Ordre vom 26.10.1871 bestimmte die Aufteilung der Werft-Division in eine Werft-Division der Ostseeflotte in Kiel und eine Werft-Division der Nordseeflotte in Wilhelmshaven.
Beide Divisionen bestand aus einer Maschinisten- und einer Handwerkerkompanie.
Ende Juni/Anfang Juli 1872 erfolgte die Umbenennungen in I. (in Kiel) und II. Werftdivision.
Kommandeure waren zumeist Korvettenkapitäne oder Kapitän zur See mit Ausnahme des Konteradmiral Ludwig Bruch, Kommandeur von Mitte September 1914 bis Anfang Februar 1916.
Namhafte Kommandeure waren die späteren Stationschefs von der Goltz, Deinhard, Viktor Valois (als Vertreter des etatmäßigen Kommandeurs Kall vom April bis September 1879) und Leberecht Maaß.
Sitz des Divisionsstabes war zunächst vermutlich in der Adalbertstraße, nach Fertigstellung des Kasernement der II. Werft-Division im dortigen Stabsgebäude.
Am 30.06.1919 wurde die II. Werft-Division aufgelöst.
15.11.1871 - 10.11.1873 KKapt./Kapt.z.S. Marinus Struben
11.11.1873 - 15.10.1875 KKapt. Ludwig Hassenpflug
16.10.1875 - 29.09.1876 Kapt.z.S. Wilhelm Wickede
30.09.1876 - 17.12.1877 Kapt.z.S. Max Freiherr von der Goltz
18.12.1877 - 23.10.1880 KKapt./Kapt.s.S. Philipp von Kall
24.10.1880 - 30.04.1885 Kapt.z.S. Karl-August Deinhard
01.05.1885 - 21.09.1887 KKapt./Kapt.z.S. Hermann Chüden
22.09.1887 - 15.11.1888 Gustav Stempel
16.11.1888 - 23.04.1890 KKapt./Kapt.z.S. Walter Koch
24.04.1890 - 09.10.1891 Kapt.z.S. Oscar Schuckmann
01.04.1892 - 25.04.1893 Kapt.z.S. Friedrich von Wietersheim
26.04.1893 - 28.03.1895 Kapt.z.S. Fritz Rötger
29.03.1895 - 23.08.1895
24.08.1895 - 27.09.1897
28.09.1897 - 11.10.1897
12.10.1897 - 14.03.1898
15.03.1898 - 25.11.1898
26.11.1898 - 29.01.1899
30.01.1899 - 39.09.1901
01.10.1901 - 31.03.1903
01.04.1903 - 11.04.1904
12.04.1904 - 06.01.1906
07.01.1906 - 30.09.1907
01.10.1907 - 06.04.1908
07.04.1908 - 05.10.1910
06.10.1910 - 30.09.1913 Kapt.z.S. Leberecht Maaß
01.10.1913 - 14.09.1914
15.09.1914 - 01.02.1916
02.02.1916 -
16.04.1919 - 30.06.1919 Kapt.z.S. Rudolf Madlung